Die Mitarbeiter der Universitätsapotheke versorgen 19 Kliniken und 17 Institute der Universitätsmedizin Greifswald, fünf externe Krankenhäuser sowie den Rettungsdienst der Universitäts- und Hansestadt Greifswald und einen Teil des Rettungsdienstes des Landkreises Vorpommern-Greifswald.
Die Apotheke arbeitet eng mit den anderen im Gemeinschaftlichen Einkauf Norddeutscher Universitätsapotheken (GENUA) verbunden Apotheken in allen Fragen einer optimalen Arzneimittelversorgung zusammen.